При первом обновлении таблицы в MySQL счётчик в заголовке файлов индексов увеличивается.

Счётчик не изменяется при последующих обновлениях.

При последнем закрытии таблицы (потому что была выполнена операция FLUSH TABLES или потому, что нет места в кэше таблиц), счётчик уменьшается, если таблица была обновлена в какой-либо момент.

При восстановлении или проверке таблицы, если она в порядке, счётчик сбрасывается до нуля.

Для избежания проблем с взаимодействием с другими процессами, которые могут проверять таблицу, счётчик не уменьшается при закрытии, если он был равен нулю.

Таблица MyISAM копируется без предварительного выполнения LOCK TABLES и FLUSH TABLES.

MySQL аварийно завершил работу между обновлением и окончательным закрытием. (Таблица может оставаться в порядке, так как MySQL всегда выполняет запись для всего между каждой командой.)

Таблица была изменена командами myisamchk --recover или myisamchk --update-state в то же время, когда она использовалась mysqld.

Несколько серверов mysqld используют таблицу, и один сервер выполнил REPAIR TABLE или CHECK TABLE над таблицей, в то время как другой сервер её использовал. В этом случае безопасно использовать CHECK TABLE, хотя вы можете получить предупреждение от других серверов. Однако следует избегать REPAIR TABLE, так как когда один сервер заменяет файл данных новым, об этом не известно другим серверам.

В общем, не рекомендуется использовать общую директорию данных для нескольких серверов. Дополнительная информация приведена в Разделе 5.7, «Запуск нескольких экземпляров MySQL на одном компьютере».