создать-версию-хранилища-аннотаций

Описание

Создаёт новую версию хранилища аннотаций.

См. также: Документацию API AWS

Синтаксис

  create-annotation-store-version
--name <value>
--version-name <value>
[--description <value>]
[--version-options <value>]
[--tags <value>]
[--cli-input-json | --cli-input-yaml]
[--generate-cli-skeleton <value>]
[--debug]
[--endpoint-url <value>]
[--no-verify-ssl]
[--no-paginate]
[--output <value>]
[--query <value>]
[--profile <value>]
[--region <value>]
[--version <value>]
[--color <value>]
[--no-sign-request]
[--ca-bundle <value>]
[--cli-read-timeout <value>]
[--cli-connect-timeout <value>]
[--cli-binary-format <value>]
[--no-cli-pager]
[--cli-auto-prompt]
[--no-cli-auto-prompt]

Параметры

--name (строка)

--version-name (строка)

--description (строка)

--version-options (структура помеченного объединения)

Краткая запись:

tsvVersionOptions={annotationType=string,formatToHeader={KeyName1=string,KeyName2=string},schema=[{KeyName1=string,KeyName2=string},{KeyName1=string,KeyName2=string}]}

Синтаксис JSON:

{
  "tsvVersionOptions": {
    "annotationType": "GENERIC"|"CHR_POS"|"CHR_POS_REF_ALT"|"CHR_START_END_ONE_BASE"|"CHR_START_END_REF_ALT_ONE_BASE"|"CHR_START_END_ZERO_BASE"|"CHR_START_END_REF_ALT_ZERO_BASE",
    "formatToHeader": {"CHR"|"START"|"END"|"REF"|"ALT"|"POS": "string"
      ...},
    "schema": [
      {"string": "LONG"|"INT"|"STRING"|"FLOAT"|"DOUBLE"|"BOOLEAN"
        ...}
      ...
    ]
  }
}

--tags (массив)

Краткая запись:

KeyName1=string,KeyName2=string

Синтаксис JSON:

{"string": "string"
  ...}

--cli-input-json | --cli-input-yaml (строка) Читает аргументы из предоставленной JSON-строки. JSON-строка следует формату, заданному --generate-cli-skeleton. Если другие аргументы предоставлены в командной строке, эти значения перекроют значения, предоставленные через JSON. Невозможно передать произвольные двоичные значения с помощью значения, предоставленного через JSON, так как строка будет воспринята буквально. Это не может быть задано вместе с --cli-input-yaml.

--generate-cli-skeleton (строка) Выводит JSON-скелет в стандартный вывод без отправки запроса к API. Если предоставлено значение без значения или со значением input, выводится пример входного JSON, который может быть использован в качестве аргумента для --cli-input-json. Аналогично, если предоставлено yaml-input, выводится пример входного YAML, который может быть использован с --cli-input-yaml. Если предоставлено значение output, проверяются входные данные команды и возвращается пример выходного JSON для этой команды. Сгенерированный JSON-скелет не стабилен между версиями AWS CLI, и нет гарантий обратной совместимости в сгенерированном JSON-скелете.

Глобальные параметры

--debug (булево)

Включить отладовую запись журнала.

--endpoint-url (строка)

Переопределить URL по умолчанию команды указанным URL.

--no-verify-ssl (булево)

По умолчанию AWS CLI использует SSL при общении с сервисами AWS. Для каждого соединения SSL AWS CLI будет проверять сертификаты SSL. Этот параметр переопределяет поведение проверки сертификатов SSL по умолчанию.

--no-paginate (булево)

Отключить автоматическую постраничную навигацию. Если автоматическая постраничная навигация отключена, AWS CLI выполнит только один вызов для первой страницы результатов.

--output (строка)

Стиль форматирования вывода команды.

• json
• text
• таблица
• yaml
• yaml-поток

--query (строка)

Запрос JMESPath для фильтрации данных ответа.

--profile (строка)

Использовать определенный профиль из файла учетных данных.

--region (строка)

Используемый регион. Переопределяет настройки конфигурации/среды.

--version (строка)

Отобразить версию этого инструмента.

--color (строка)

Включить/выключить цветной вывод.

• включено
• выключено
• автоматически

--no-sign-request (булево)

Не подписывать запросы. Учетные данные не будут загружены, если этот аргумент предоставлен.

--ca-bundle (строка)

Файл сертификатов CA для использования при проверке сертификатов SSL. Переопределяет настройки конфигурации/среды.

--cli-read-timeout (целое число)

Максимальное время чтения сокета в секундах. Если значение установлено в 0, чтение сокета будет блокирующим и без таймаута. Значение по умолчанию составляет 60 секунд.

--cli-connect-timeout (целое число)

Максимальное время подключения сокета в секундах. Если значение установлено в 0, подключение сокета будет блокирующим и без таймаута. Значение по умолчанию составляет 60 секунд.

--cli-binary-format (строка)

Стиль форматирования, используемый для двоичных блоков. Формат по умолчанию - base64. Формат base64 ожидает, что двоичные блоки будут предоставлены как base64-кодированная строка. Формат raw-in-base64-out сохраняет совместимость с поведением AWS CLI V1, и двоичные значения должны передаваться буквально. При предоставлении содержимого из файла, которое сопоставляется с двоичным блоком, fileb:// всегда будет обрабатываться как двоичный и использовать содержимое файла напрямую независимо от настройки cli-binary-format. При использовании file:// содержимое файла должно быть правильно отформатировано для настроенного cli-binary-format.

• base64
• raw-in-base64-out

--no-cli-pager (булево)

Отключить пейджер CLI для вывода.

--cli-auto-prompt (булево)

Автоматически запрашивать параметры ввода CLI.

--no-cli-auto-prompt (булево)

Отключить автоматическое запроса параметров ввода CLI.

Примеры

Для создания новой версии хранилища аннотаций

Следующий create-annotation-store-version пример создаёт новую версию хранилища аннотаций.

aws omics create-annotation-store-version \
    --name my_annotation_store \
    --version-name my_version

Вывод:

{
    "creationTime": "2023-07-21T17:15:49.251040+00:00",
    "id": "3b93cdef69d2",
    "name": "my_annotation_store",
    "reference": {
        "referenceArn": "arn:aws:omics:us-west-2:555555555555:referenceStore/6505293348/reference/5987565360"
    },
    "status": "CREATING",
    "versionName": "my_version"
}

Дополнительную информацию см. в разделе «Создание новых версий хранилищ аннотаций» в руководстве пользователя AWS HealthOmics.

Вывод

id -> (строка)

versionName -> (строка)

storeId -> (строка)

versionOptions -> (структура помеченного объединения)

name -> (строка)

status -> (строка)

creationTime -> (метка времени)