создать-многочастотный-загрузку-набора-чтений

Описание

Начинает многочастотную загрузку набора чтений.

См. также: Документацию API AWS

Синтаксис

  create-multipart-read-set-upload
--sequence-store-id <value>
[--client-token <value>]
--source-file-type <value>
--subject-id <value>
--sample-id <value>
[--generated-from<value>]
[--reference-arn <value>]
--name <value>
[--description <value>]
[--tags <value>]
[--cli-input-json | --cli-input-yaml]
[--generate-cli-skeleton <value>]
[--debug]
[--endpoint-url <value>]
[--no-verify-ssl]
[--no-paginate]
[--output <value>]
[--query <value>]
[--profile <value>]
[--region <value>]
[--version <value>]
[--color <value>]
[--no-sign-request]
[--ca-bundle <value>]
[--cli-read-timeout <value>]
[--cli-connect-timeout <value>]
[--cli-binary-format <value>]
[--no-cli-pager]
[--cli-auto-prompt]
[--no-cli-auto-prompt]

Параметры

--sequence-store-id (строка)

--client-token (строка)

--source-file-type (строка)

--subject-id (строка)

--sample-id (строка)

--generated-from (строка)

--reference-arn (строка)

--name (строка)

--description (строка)

--tags (карта)

Краткая синтаксическая запись:

KeyName1=string,KeyName2=string

Синтаксис JSON:

{"string": "string"
  ...}

--cli-input-json | --cli-input-yaml (строка) Считывает аргументы из предоставленной JSON-строки. JSON-строка следует формату, предоставленному --generate-cli-skeleton. Если на командной строке предоставлены другие аргументы, эти значения переопределят значения, предоставленные JSON. Невозможно передавать произвольные двоичные значения с помощью значения, предоставленного JSON, так как строка будет взята дословно. Это может не быть указано вместе с --cli-input-yaml.

--generate-cli-skeleton (строка) Выводит JSON-скелет в стандартный вывод без отправки запроса API. Если предоставлено без значения или со значением input, выводит пример входного JSON, который можно использовать в качестве аргумента для --cli-input-json. Аналогично, если предоставлено yaml-input, он выведет пример входного YAML, который можно использовать с --cli-input-yaml. Если предоставлено значение output, оно проверяет входные данные команды и возвращает пример выходного JSON для этой команды. Сгенерированный JSON-скелет не стабилен между версиями AWS CLI, и нет гарантий обратной совместимости в сгенерированном JSON-скелете.

Глобальные параметры

--debug (логическое значение)

Включить отладку регистрации.

--endpoint-url (строка)

Переопределить URL по умолчанию команды заданным URL.

--no-verify-ssl (логическое значение)

По умолчанию AWS CLI использует SSL при общении с сервисами AWS. Для каждого подключения SSL AWS CLI будет проверять сертификаты SSL. Этот параметр переопределяет поведение по умолчанию проверки сертификатов SSL.

--no-paginate (логическое значение)

Отключить автоматическую постраничную навигацию. Если автоматическая постраничная навигация отключена, AWS CLI сделает только один вызов для первой страницы результатов.

--output (строка)

Стиль форматирования для вывода команды.

• json
• текст
• таблица
• yaml
• yaml-поток

--query (строка)

Запрос JMESPath для использования при фильтрации данных ответа.

--profile (строка)

Использование определенного профиля из файла учетных данных.

--region (строка)

Регион для использования. Переопределяет настройки конфигурации/среды.

--version (строка)

Отображение версии этого инструмента.

--color (строка)

Включение/выключение цветного вывода.

• включено
• выключено
• автоматически

--no-sign-request (логическое значение)

Не подписывать запросы. Учетные данные не будут загружаться, если этот аргумент предоставлен.

--ca-bundle (строка)

Образец файла сертификата CA для использования при проверке сертификатов SSL. Переопределяет настройки конфигурации/среды.

--cli-read-timeout (целое число)

Максимальное время чтения сокета в секундах. Если значение установлено в 0, чтение сокета будет блокирующим и не будет ограничено по времени. Значение по умолчанию составляет 60 секунд.

--cli-connect-timeout (целое число)

Максимальное время подключения сокета в секундах. Если значение установлено в 0, подключение сокета будет блокирующим и не будет ограничено по времени. Значение по умолчанию составляет 60 секунд.

--cli-binary-format (строка)

Стиль форматирования, используемый для двоичных блоков. Формат по умолчанию — base64. Формат base64 ожидает, что двоичные блоки будут предоставлены в виде закодированной строкой base64. Формат raw-in-base64-out сохраняет совместимость с поведением AWS CLI V1, и двоичные значения должны быть переданы дословно. При предоставлении содержимого из файла, соответствующего двоичному блоку, fileb:// всегда будет обрабатываться как двоичный, и будет использоваться содержимое файла напрямую независимо от настройки cli-binary-format. При использовании file:// содержимое файла должно быть должным образом отформатировано для настроенного cli-binary-format.

• base64
• raw-in-base64-out

--no-cli-pager (логическое значение)

Отключить кли-пейджер для вывода.

--cli-auto-prompt (логическое значение)

Автоматически запросить параметры входных данных CLI.

--no-cli-auto-prompt (логическое значение)

Отключить автоматическое запросы параметров входных данных CLI.

Примеры

Чтобы начать многочастотную загрузку набора чтений.

Следующий пример create-multipart-read-set-upload инициирует многочастотную загрузку набора чтений.

aws omics create-multipart-read-set-upload \
    --sequence-store-id 0123456789 \
    --name HG00146 \
    --source-file-type FASTQ \
    --subject-id mySubject\
    --sample-id mySample\
    --description "FASTQ for HG00146"\
    --generated-from"1000 Genomes"

Вывод:

{
    "creationTime": "2022-07-13T23:25:20Z",
    "description": "FASTQ for HG00146",
    "generatedFrom": "1000 Genomes",
    "name": "HG00146",
    "sampleId": "mySample",
    "sequenceStoreId": "0123456789",
    "sourceFileType": "FASTQ",
    "subjectId": "mySubject",
    "uploadId": "1122334455"
}

Дополнительную информацию см. в разделе Прямая загрузка в хранилище последовательностей в руководстве пользователя AWS HealthOmics.

Вывод

sequenceStoreId -> (строка)

uploadId -> (строка)

sourceFileType -> (строка)

subjectId -> (строка)

sampleId -> (строка)

generatedFrom -> (строка)

referenceArn -> (строка)

name -> (строка)

description -> (строка)

tags -> (карта)

creationTime -> (метка времени)