get-run

Описание

Получает информацию о выполнении рабочего процесса.

Если рабочий процесс с вами общий, вы не можете экспортировать информацию о выполнении.

Amazon Web Services HealthOmics хранит фиксированное количество запусков, доступных в консоли и через API. Если GetRun не возвращает запрашиваемый запуск, вы можете найти журналы запусков для всех запусков в журналах CloudWatch. Дополнительную информацию о просмотре журналов запусков см. в разделе Журналы CloudWatch в Руководстве пользователя Amazon Web Services HealthOmics.

См. также: Документацию API AWS

get-run использует значения типов документов. Типы документов следуют модели данных JSON, где допустимые значения: строки, числа, булевы значения, null, массивы и объекты. Для входных данных команд, опций и вложенных параметров, помеченных типом document, необходимо предоставить JSON. Краткая синтаксическая запись не поддерживает типы документов.

Синтаксис

  get-run
--id <value>
[--export <value>]
[--cli-input-json | --cli-input-yaml]
[--generate-cli-skeleton <value>]
[--debug]
[--endpoint-url <value>]
[--no-verify-ssl]
[--no-paginate]
[--output <value>]
[--query <value>]
[--profile <value>]
[--region <value>]
[--version <value>]
[--color <value>]
[--no-sign-request]
[--ca-bundle <value>]
[--cli-read-timeout <value>]
[--cli-connect-timeout <value>]
[--cli-binary-format <value>]
[--no-cli-pager]
[--cli-auto-prompt]
[--no-cli-auto-prompt]

Параметры

--id (строка)

--export (список)

Синтаксис:

"string" "string" ...

Where valid values are:
  DEFINITION

--cli-input-json | --cli-input-yaml (строка) Считывает аргументы из предоставленной JSON-строки. JSON-строка следует формату, предоставленному --generate-cli-skeleton. Если другие аргументы предоставлены в командной строке, эти значения переопределят значения, предоставленные JSON. Невозможно передавать произвольные двоичные значения с помощью предоставленного JSON-значения, так как строка будет интерпретироваться буквально. Это не может быть указано вместе с --cli-input-yaml.

--generate-cli-skeleton (строка) Выводит JSON-скелет в стандартный вывод без отправки запроса к API. При отсутствии значения или значении input выводит пример входного JSON, который можно использовать в качестве аргумента для --cli-input-json. Аналогично, при значении yaml-input он выведет пример входного YAML, который можно использовать с --cli-input-yaml. При значении output он проверит входные данные команды и вернёт пример выходного JSON для этой команды. Сгенерированный JSON-скелет не стабилен между версиями AWS CLI, и нет гарантий обратной совместимости в сгенерированном JSON-скелете.

Глобальные параметры

--debug (булево)

Включить отладочную запись в журналы.

--endpoint-url (строка)

Переопределить URL по умолчанию команды заданным URL.

--no-verify-ssl (булево)

По умолчанию AWS CLI использует SSL при общении с сервисами AWS. Для каждого SSL-соединения AWS CLI будет проверять SSL-сертификаты. Этот параметр переопределяет поведение по умолчанию проверки SSL-сертификатов.

--no-paginate (булево)

Отключить автоматическую постраничную навигацию. Если автоматическая постраничная навигация отключена, AWS CLI сделает только один вызов для первой страницы результатов.

--output (строка)

Стиль форматирования для вывода команды.

• json
• text
• table
• yaml
• yaml-stream

--query (строка)

Запрос JMESPath для фильтрации данных ответа.

--profile (строка)

Использовать определённый профиль из файла ваших учетных данных.

--region (строка)

Регион для использования. Переопределяет параметры из конфигурации/среды.

--version (строка)

Отобразить версию этого инструмента.

--color (строка)

Включить/выключить цветной вывод.

• on
• off
• auto

--no-sign-request (булево)

Не подписывать запросы. Учетные данные не будут загружены, если этот аргумент указан.

--ca-bundle (строка)

Файл с пакетом сертификатов CA для проверки SSL-сертификатов. Переопределяет параметры из конфигурации/среды.

--cli-read-timeout (целое число)

Максимальное время чтения сокета в секундах. Если значение установлено в 0, чтение сокета будет блокирующим и без таймаута. Значение по умолчанию — 60 секунд.

--cli-connect-timeout (целое число)

Максимальное время подключения к сокету в секундах. Если значение установлено в 0, подключение к сокету будет блокирующим и без таймаута. Значение по умолчанию — 60 секунд.

--cli-binary-format (строка)

Стиль форматирования, используемый для двоичных блоков. Формат по умолчанию — base64. Формат base64 ожидает, что двоичные блоки будут предоставлены как строка, закодированная в base64. Формат raw-in-base64-out сохраняет совместимость с поведением AWS CLI версии 1, и двоичные значения должны передаваться буквально. При предоставлении содержимого из файла, отображающего двоичный блок, fileb:// всегда будет обрабатываться как двоичный и будет использовать содержимое файла непосредственно, независимо от параметра cli-binary-format. При использовании file:// содержимое файла должно быть должным образом отформатировано для настроенного параметра cli-binary-format.

• base64
• raw-in-base64-out

--no-cli-pager (булево)

Отключить кли-паджинатор для вывода.

--cli-auto-prompt (булево)

Автоматически запрашивать параметры ввода CLI.

--no-cli-auto-prompt (булево)

Отключить автоматическое запросы параметров ввода CLI.

Примеры

Для просмотра выполнения рабочего процесса

Следующий get-run пример получает подробности о выполнении рабочего процесса.

aws omics get-run \
    --id 1234567

Вывод:

{
    "arn": "arn:aws:omics:us-west-2:123456789012:run/1234567",
    "creationTime": "2022-11-30T22:58:22.615865Z",
    "digest": "sha256:c54bxmpl742dcc26f7fa1f10e37550ddd8f251f418277c0a58e895b801ed28cf",
    "id": "1234567",
    "name": "cram-to-bam",
    "outputUri": "s3://omics-artifacts-01d6xmpl4e72dd32/workflow-output/",
    "parameters": {
        "ref_dict": "s3://omics-artifacts-01d6xmpl4e72dd32/Homo_sapiens_assembly38.dict",
        "ref_fasta_index": "s3://omics-artifacts-01d6xmpl4e72dd32/Homo_sapiens_assembly38.fasta.fai",
        "ref_fasta": "s3://omics-artifacts-01d6xmpl4e72dd32/Homo_sapiens_assembly38.fasta",
        "sample_name": "NA12878",
        "input_cram": "s3://omics-artifacts-01d6xmpl4e72dd32/NA12878.cram"
    },
    "resourceDigests": {
        "s3://omics-artifacts-01d6xmpl4e72dd32/Homo_sapiens_assembly38.fasta.fai": "etag:f76371b113734a56cde236bc0372de0a",
        "s3://omics-artifacts-01d6xmpl4e72dd32/Homo_sapiens_assembly38.dict": "etag:3884c62eb0e53fa92459ed9bff133ae6",
        "s3://omics-artifacts-01d6xmpl4e72dd32/Homo_sapiens_assembly38.fasta": "etag:e307d81c605fb91b7720a08f00276842-388",
        "s3://omics-artifacts-01d6xmpl4e72dd32/NA12878.cram": "etag:a9f52976381286c6143b5cc681671ec6"
    },
    "roleArn": "arn:aws:iam::123456789012:role/omics-service-role-serviceRole-W8O1XMPL7QZ",
    "startedBy": "arn:aws:iam::123456789012:user/laptop-2020",
    "status": "STARTING",
    "tags": {},
    "workflowId": "1234567",
    "workflowType": "PRIVATE"
}

Дополнительную информацию см. в разделе «Рабочие процессы Omics» в руководстве разработчика Amazon Omics.

Вывод

arn -> (строка)

id -> (строка)

cacheId -> (строка)

cacheBehavior -> (строка)

engineVersion -> (строка)

status -> (строка)

workflowId -> (строка)

workflowType -> (строка)

runId -> (строка)

roleArn -> (строка)

name -> (строка)

runGroupId -> (строка)

priority -> (целое число)

definition -> (строка)

digest -> (строка)

parameters -> (документ)

storageCapacity -> (целое число)

outputUri -> (строка)

logLevel -> (строка)

resourceDigests -> (карта)

startedBy -> (строка)

creationTime -> (временная метка)

startTime -> (временная метка)

stopTime -> (временная метка)

statusMessage -> (строка)

tags -> (карта)

accelerators -> (строка)

retentionMode -> (строка)

failureReason -> (строка)

logLocation -> (структура)

uuid -> (строка)

runOutputUri -> (строка)

storageType -> (строка)

workflowOwnerId -> (строка)

workflowVersionName -> (строка)

workflowUuid -> (строка)