list-multipart-read-set-uploads

Описание

Перечисляет загрузки наборов считанных данных по частям и для загрузках в процессе. После завершения загрузки создается набор считанных данных, и загрузка больше не будет возвращаться в ответе.

См. также: Документацию API AWS

list-multipart-read-set-uploads является постраничной операцией. Для получения всего набора результатов могут быть выпущены несколько вызовов API. Вы можете отключить постраничный вывод, указав аргумент --no-paginate. При использовании --output text и аргумента --query в ответе с постраничным выводом, аргумент --query должен извлекать данные из результатов следующих выражений запроса: uploads

Синтаксис

  list-multipart-read-set-uploads
--sequence-store-id <value>
[--cli-input-json | --cli-input-yaml]
[--starting-token <value>]
[--page-size <value>]
[--max-items <value>]
[--generate-cli-skeleton <value>]
[--debug]
[--endpoint-url <value>]
[--no-verify-ssl]
[--no-paginate]
[--output <value>]
[--query <value>]
[--profile <value>]
[--region <value>]
[--version <value>]
[--color <value>]
[--no-sign-request]
[--ca-bundle <value>]
[--cli-read-timeout <value>]
[--cli-connect-timeout <value>]
[--cli-binary-format <value>]
[--no-cli-pager]
[--cli-auto-prompt]
[--no-cli-auto-prompt]

Параметры

--sequence-store-id (строка)

--cli-input-json | --cli-input-yaml (строка) Читает аргументы из предоставленной JSON-строки. JSON-строка следует формату, заданному --generate-cli-skeleton. Если другие аргументы предоставлены в командной строке, эти значения перепишут значения, предоставленные JSON-строкой. Невозможно передавать произвольные двоичные значения с помощью значения, предоставленного JSON-строкой, так как строка будет воспринята буквально. Это не может быть указано вместе с --cli-input-yaml.

--starting-token (строка)

--page-size (целое число)

--max-items (целое число)

--generate-cli-skeleton (строка) Выводит JSON-скелет в стандартный вывод без отправки запроса к API. Если указано без значения или со значением input, выводит пример входного JSON, который можно использовать в качестве аргумента для --cli-input-json. Аналогично, если указано yaml-input, выводит пример входного YAML, который можно использовать с --cli-input-yaml. Если указано значение output, проверяет входные данные команды и возвращает пример выходного JSON для этой команды. Сгенерированный JSON-скелет нестабилен между версиями AWS CLI и не гарантируется обратная совместимость сгенерированного JSON-скелета.

Глобальные параметры

--debug (boolean)

Включить отладочную запись журнала.

--endpoint-url (string)

Переопределить стандартный URL команды заданным URL.

--no-verify-ssl (boolean)

По умолчанию AWS CLI использует SSL при взаимодействии с AWS-сервисами. Для каждого SSL-соединения AWS CLI будет проверять SSL-сертификаты. Этот параметр переопределяет поведение проверки SSL-сертификатов по умолчанию.

--no-paginate (boolean)

Отключить автоматическую постраничную навигацию. Если автоматическая постраничная навигация отключена, AWS CLI выполнит только один вызов для первой страницы результатов.

--output (string)

Стиль форматирования вывода команды.

• json
• text
• table
• yaml
• yaml-stream

--query (string)

Запрос JMESPath для фильтрации данных ответа.

--profile (string)

Использовать определённый профиль из файла идентификаторов.

--region (string)

Регион для использования. Переопределяет параметры конфигурации/среды.

--version (string)

Отобразить версию этого инструмента.

--color (string)

Включить/отключить цветной вывод.

• on
• off
• auto

--no-sign-request (boolean)

Не подписывать запросы. Идентификаторы не будут загружены, если этот аргумент указан.

--ca-bundle (string)

Файл с сертификатом CA для проверки SSL-сертификатов. Переопределяет настройки конфигурации/среды.

--cli-read-timeout (int)

Максимальное время чтения сокета в секундах. Если значение установлено в 0, чтение сокета будет выполняться без блокировки и без таймаута. Значение по умолчанию — 60 секунд.

--cli-connect-timeout (int)

Максимальное время подключения сокета в секундах. Если значение установлено в 0, подключение сокета будет выполняться без блокировки и без таймаута. Значение по умолчанию — 60 секунд.

--cli-binary-format (string)

Стиль форматирования, используемый для бинарных блоков. По умолчанию используется формат base64. Формат base64 предполагает, что бинарные блоки предоставляются в виде закодированной в base64 строки. Формат raw-in-base64-out сохраняет совместимость с поведением AWS CLI V1, и бинарные значения должны передаваться буквально. При предоставлении содержимого из файла, которое соответствует бинарному блоку, fileb:// всегда будет обрабатываться как бинарное и использовать содержимое файла напрямую независимо от настроек cli-binary-format. При использовании file:// содержимое файла должно быть правильно отформатировано для настроенного cli-binary-format.

• base64
• raw-in-base64-out

--no-cli-pager (boolean)

Отключить пагинатор CLI для вывода.

--cli-auto-prompt (boolean)

Автоматически запрашивать параметры ввода CLI.

--no-cli-auto-prompt (boolean)

Отключить автоматическую запрос параметров ввода CLI.

Примеры

Для перечисления всех загрузок наборов считывания multipart и их статусов.

Следующий list-multipart-read-set-uploads пример перечисляет все загрузки наборов считывания multipart и их статусы.

aws omics list-multipart-read-set-uploads \
    --sequence-store-id 0123456789

Вывод:

{
"uploads":
    [
        {
           "sequenceStoreId": "0123456789",
           "uploadId": "8749584421",
           "sourceFileType": "FASTQ",
            "subjectId": "mySubject",
            "sampleId": "mySample",
            "generatedFrom": "1000 Genomes",
            "name": "HG00146",
            "description": "FASTQ for HG00146",
            "creationTime": "2023-11-29T19:22:51.349298+00:00"
        },
        {
            "sequenceStoreId": "0123456789",
            "uploadId": "5290538638",
            "sourceFileType": "BAM",
            "subjectId": "mySubject",
            "sampleId": "mySample",
            "generatedFrom": "1000 Genomes",
            "referenceArn": "arn:aws:omics:us-west-2:845448930428:referenceStore/8168613728/reference/2190697383",
            "name": "HG00146",
            "description": "BAM for HG00146",
            "creationTime": "2023-11-29T19:23:33.116516+00:00"
        },
        {
            "sequenceStoreId": "0123456789",
            "uploadId": "4174220862",
            "sourceFileType": "BAM",
            "subjectId": "mySubject",
            "sampleId": "mySample",
            "generatedFrom": "1000 Genomes",
            "referenceArn": "arn:aws:omics:us-west-2:845448930428:referenceStore/8168613728/reference/2190697383",
            "name": "HG00147",
            "description": "BAM for HG00147",
            "creationTime": "2023-11-29T19:23:47.007866+00:00"
        }
    ]
}

Дополнительную информацию см. в разделе «Прямая загрузка в хранилище последовательностей» в Руководстве пользователя AWS HealthOmics.

Вывод

nextToken -> (строка)

uploads -> (список)