list-read-sets

Описание

Получает список наборов чтений.

См. также: Документацию API AWS

list-read-sets является постраничной операцией. Для получения всего набора результатов могут быть вызваны несколько вызовов API. Вы можете отключить постраничность, предоставив аргумент --no-paginate. При использовании --output text и аргумента --query в ответе с постраничностью, аргумент --query должен извлечь данные из результатов следующих выражений запроса: readSets

Синтаксис

  list-read-sets
--sequence-store-id <value>
[--filter <value>]
[--cli-input-json | --cli-input-yaml]
[--starting-token <value>]
[--page-size <value>]
[--max-items <value>]
[--generate-cli-skeleton <value>]
[--debug]
[--endpoint-url <value>]
[--no-verify-ssl]
[--no-paginate]
[--output <value>]
[--query <value>]
[--profile <value>]
[--region <value>]
[--version <value>]
[--color <value>]
[--no-sign-request]
[--ca-bundle <value>]
[--cli-read-timeout <value>]
[--cli-connect-timeout <value>]
[--cli-binary-format <value>]
[--no-cli-pager]
[--cli-auto-prompt]
[--no-cli-auto-prompt]

Параметры

--sequence-store-id (строка)

--filter (структура)

Сокращенный синтаксис:

name=string,status=string,referenceArn=string,createdAfter=timestamp,createdBefore=timestamp,sampleId=string,subjectId=string,generatedFrom=string,creationType=string

Синтаксис JSON:

{
  "name": "string",
  "status": "ARCHIVED"|"ACTIVATING"|"ACTIVE"|"DELETING"|"DELETED"|"PROCESSING_UPLOAD"|"UPLOAD_FAILED",
  "referenceArn": "string",
  "createdAfter": timestamp,
  "createdBefore": timestamp,
  "sampleId": "string",
  "subjectId": "string",
  "generatedFrom": "string",
  "creationType": "IMPORT"|"UPLOAD"
}

--cli-input-json | --cli-input-yaml (строка) Считывает аргументы из предоставленной строки JSON. Строка JSON следует формату, указанному в --generate-cli-skeleton. Если на командной строке указаны другие аргументы, эти значения переопределяют значения, предоставленные JSON. Невозможно передавать произвольные двоичные значения с помощью предоставленного значения JSON, так как строка будет взята буквально. Это не может быть указано вместе с --cli-input-yaml.

--starting-token (строка)

--page-size (целое число)

--max-items (целое число)

--generate-cli-skeleton (строка) Выводит JSON-скелет в стандартный вывод без отправки запроса API. Если предоставлено значение без значения или со значением input, выводит пример входного JSON, который может быть использован в качестве аргумента для --cli-input-json. Аналогично, если предоставлено yaml-input, оно выведет пример входного YAML, который может быть использован с --cli-input-yaml. Если предоставлено значение output, оно проверяет входные данные команды и возвращает пример выходного JSON для данной команды. Сгенерированный JSON-скелет не является стабильным между версиями AWS CLI, и нет гарантии обратной совместимости в сгенерированном JSON-скелете.

Глобальные параметры

--debug (булево)

Включить отладочную запись в журнал.

--endpoint-url (строка)

Переопределить URL по умолчанию команды указанным URL.

--no-verify-ssl (булево)

По умолчанию AWS CLI использует SSL при общении с AWS-сервисами. Для каждого SSL-соединения AWS CLI будет проверять сертификаты SSL. Этот параметр переопределяет поведение проверки сертификатов SSL по умолчанию.

--no-paginate (булево)

Отключить автоматическую постраничность. Если автоматическая постраничность отключена, AWS CLI выполнит только один вызов для первой страницы результатов.

--output (строка)

Стиль форматирования вывода команды.

• json
• text
• table
• yaml
• yaml-stream

--query (строка)

Выражение JMESPath для использования в фильтрации данных ответа.

--profile (строка)

Использовать определенный профиль из файла учетных данных.

--region (строка)

Регион для использования. Переопределяет параметры конфигурации/среды.

--version (строка)

Отобразить версию этого инструмента.

--color (строка)

Включить/выключить цветной вывод.

• on
• off
• auto

--no-sign-request (булево)

Не подписывать запросы. Учетные данные не будут загружены, если этот аргумент предоставлен.

--ca-bundle (строка)

Пучок сертификатов CA для использования при проверке сертификатов SSL. Переопределяет параметры конфигурации/среды.

--cli-read-timeout (целое число)

Максимальное время чтения сокета в секундах. Если значение установлено в 0, чтение сокета будет блокирующим и не будет ограничено по времени. Значение по умолчанию составляет 60 секунд.

--cli-connect-timeout (целое число)

Максимальное время подключения сокета в секундах. Если значение установлено в 0, подключение сокета будет блокирующим и не будет ограничено по времени. Значение по умолчанию составляет 60 секунд.

--cli-binary-format (строка)

Стиль форматирования, используемый для двоичных блоков. Формат по умолчанию — base64. Формат base64 ожидает, что двоичные блоки будут предоставлены как строка, закодированная в base64. Формат raw-in-base64-out сохраняет совместимость с поведением AWS CLI V1, и двоичные значения должны быть переданы буквально. При предоставлении содержимого из файла, отображающего двоичный блок, fileb:// всегда будет обрабатываться как двоичный и будет использовать содержимое файла непосредственно независимо от настройки cli-binary-format. При использовании file:// содержимое файла должно быть должным образом отформатировано для настроенного cli-binary-format.

• base64
• raw-in-base64-out

--no-cli-pager (булево)

Отключить кли-переключатель для вывода.

--cli-auto-prompt (булево)

Автоматически запрашивать параметры входных данных CLI.

--no-cli-auto-prompt (булево)

Отключить автоматическое запрошенние параметров входных данных CLI.

Примеры

Для получения списка наборов чтений

Следующий пример list-read-sets получает список наборов чтений для хранилища последовательностей с идентификатором 1234567890.

aws omics list-read-sets \
    --sequence-store-id 1234567890

Вывод:

{
    "readSets": [
        {
            "arn": "arn:aws:omics:us-west-2:123456789012:sequenceStore/1234567890/readSet/1234567890",
            "creationTime": "2022-11-23T21:55:00.515Z",
            "fileType": "FASTQ",
            "id": "1234567890",
            "name": "HG00146",
            "referenceArn": "arn:aws:omics:us-west-2:123456789012:referenceStore/1234567890/reference/1234567890",
            "sampleId": "fastq-sample",
            "sequenceStoreId": "1234567890",
            "status": "ACTIVE",
            "subjectId": "fastq-subject"
        }
    ]
}

Для получения дополнительной информации см. раздел Хранилище омики в Руководстве разработчика Amazon Omics.

Вывод

nextToken -> (строка)

readSets -> (список)