start-read-set-export-job

Описание

Экспорт набора считываний в Amazon S3.

См. также: Документацию API AWS

Синтаксис

  start-read-set-export-job
--sequence-store-id <value>
--destination <value>
--role-arn <value>
[--client-token <value>]
--sources <value>
[--cli-input-json | --cli-input-yaml]
[--generate-cli-skeleton <value>]
[--debug]
[--endpoint-url <value>]
[--no-verify-ssl]
[--no-paginate]
[--output <value>]
[--query <value>]
[--profile <value>]
[--region <value>]
[--version <value>]
[--color <value>]
[--no-sign-request]
[--ca-bundle <value>]
[--cli-read-timeout <value>]
[--cli-connect-timeout <value>]
[--cli-binary-format <value>]
[--no-cli-pager]
[--cli-auto-prompt]
[--no-cli-auto-prompt]

Параметры

--sequence-store-id (строка)

--destination (строка)

--role-arn (строка)

--client-token (строка)

--sources (список)

Сокращённый синтаксис:

readSetId=string ...

Синтаксис JSON:

[
  {
    "readSetId": "string"
  }
  ...
]

--cli-input-json | --cli-input-yaml (строка) Считывает аргументы из предоставленной строки JSON. Строка JSON следует формату, предоставленному --generate-cli-skeleton. Если другие аргументы предоставлены в командной строке, эти значения переопределят значения, предоставленные в JSON. Невозможно передать произвольные двоичные значения с помощью значения, предоставленного в JSON, так как строка будет взята буквально. Это не может быть указано вместе с --cli-input-yaml.

--generate-cli-skeleton (строка) Выводит каркас JSON в стандартный вывод без отправки запроса к API. Если предоставлено без значения или со значением input, выводит пример входного JSON, который можно использовать как аргумент для --cli-input-json. Аналогично, если предоставлено yaml-input, это выведет пример входного YAML, который можно использовать с --cli-input-yaml. Если предоставлено значение output, оно проверяет входные данные команды и возвращает пример выходного JSON для этой команды. Сгенерированный JSON-каркас не стабилен между версиями AWS CLI и не имеет гарантий обратной совместимости в сгенерированном JSON-каркасе.

Глобальные параметры

--debug (логическое значение)

Включить отладку логирования.

--endpoint-url (строка)

Переопределить URL по умолчанию команды заданным URL.

--no-verify-ssl (логическое значение)

По умолчанию AWS CLI использует SSL при общении с AWS-сервисами. Для каждого SSL-соединения AWS CLI будет проверять сертификаты SSL. Этот параметр переопределяет поведение проверки сертификатов SSL по умолчанию.

--no-paginate (логическое значение)

Отключить автоматическую постраничную навигацию. Если автоматическая постраничная навигация отключена, AWS CLI сделает только один вызов для первой страницы результатов.

--output (строка)

Стиль форматирования вывода команды.

• json
• text
• таблица
• yaml
• yaml-поток

--query (строка)

Запрос JMESPath для фильтрации данных ответа.

--profile (строка)

Использовать определённый профиль из файла учетных данных.

--region (строка)

Регион для использования. Переопределяет настройки конфигурации/среды.

--version (строка)

Отобразить версию этого инструмента.

--color (строка)

Включить/выключить цветной вывод.

• включено
• выключено
• автоматически

--no-sign-request (логическое значение)

Не подписывать запросы. Учетные данные не будут загружены, если этот аргумент предоставлен.

--ca-bundle (строка)

Файл сертификатов CA для проверки SSL-сертификатов. Переопределяет настройки конфигурации/среды.

--cli-read-timeout (целое число)

Максимальное время чтения сокета в секундах. Если значение равно 0, чтение сокета будет выполняться без блокировки и без таймаута. Значение по умолчанию - 60 секунд.

--cli-connect-timeout (целое число)

Максимальное время подключения к сокету в секундах. Если значение равно 0, подключение к сокету будет выполняться без блокировки и без таймаута. Значение по умолчанию - 60 секунд.

--cli-binary-format (строка)

Стиль форматирования, используемый для двоичных блоков. Формат по умолчанию - base64. Формат base64 ожидает, что двоичные блоки будут предоставлены как закодированная строка base64. Формат raw-in-base64-out сохраняет совместимость с поведением AWS CLI V1, и двоичные значения должны передаваться буквально. При предоставлении содержимого из файла, которое соответствует двоичному блоку, fileb:// всегда будет обрабатываться как двоичное и использовать содержимое файла напрямую независимо от настройки cli-binary-format. При использовании file:// содержимое файла необходимо правильно отформатировать для настроенного cli-binary-format.

• base64
• raw-in-base64-out

--no-cli-pager (логическое значение)

Отключить вывод пейджера CLI.

--cli-auto-prompt (логическое значение)

Автоматически запросить параметры ввода CLI.

--no-cli-auto-prompt (логическое значение)

Отключить автоматическое запросы параметров ввода CLI.

Примеры

Для экспорта набора считываний

Следующий start-read-set-export-job пример экспортирует два набора считываний в Amazon S3.

   aws omics start-read-set-export-job \
       --sequence-store-id 1234567890 \
       --sources readSetId=1234567890 readSetId=1234567890 \
       --role-arn arn:aws:iam::123456789012:role/omics-service-role-serviceRole-W8O1XMPL7QZ
\
       --destination s3://omics-artifacts-01d6xmpl4e72dd32/read-set-export/

Вывод:

{
    "creationTime": "2022-12-06T22:37:18.612Z",
    "destination": "s3://omics-artifacts-01d6xmpl4e72dd32/read-set-export/",
    "id": "1234567890",
    "sequenceStoreId": "1234567890",
    "status": "SUBMITTED"
}

Дополнительную информацию см. в разделе Хранение омикс-данных в Руководстве разработчика Amazon Omics.

Вывод

id -> (строка)

sequenceStoreId -> (строка)

destination -> (строка)

status -> (строка)

creationTime -> (отметка времени)