upload-read-set-part

Описание

Эта операция загружает определённую часть набора чтений. Если вы загружаете новую часть, используя ранее использованный номер части, ранее загруженная часть будет перезаписана.

См. также: Документация API AWS

Синтаксис

  upload-read-set-part
--sequence-store-id <value>
--upload-id <value>
--part-source <value>
--part-number <value>
--payload <value>
[--cli-input-json | --cli-input-yaml]
[--generate-cli-skeleton <value>]
[--debug]
[--endpoint-url <value>]
[--no-verify-ssl]
[--no-paginate]
[--output <value>]
[--query <value>]
[--profile <value>]
[--region <value>]
[--version <value>]
[--color <value>]
[--no-sign-request]
[--ca-bundle <value>]
[--cli-read-timeout <value>]
[--cli-connect-timeout <value>]
[--cli-binary-format <value>]
[--no-cli-pager]
[--cli-auto-prompt]
[--no-cli-auto-prompt]

Параметры

--sequence-store-id (строка)

--upload-id (строка)

--part-source (строка)

--part-number (целое число)

--payload (потоковый блок)

--cli-input-json | --cli-input-yaml (строка) Считывает аргументы из предоставленной JSON-строки. JSON-строка соответствует формату, предоставленному --generate-cli-skeleton. Если на командной строке указаны другие аргументы, эти значения переопределят значения, предоставленные JSON. Передать произвольные двоичные значения с помощью значения, предоставленного JSON, невозможно, так как строка будет взята дословно. Это не может быть указано вместе с --cli-input-yaml.

--generate-cli-skeleton (строка) Выводит JSON-скелет в стандартный вывод без отправки запроса к API. Если предоставлено значение без значения или со значением input, выводит пример входного JSON, который можно использовать в качестве аргумента для --cli-input-json. Аналогично, если предоставлено yaml-input, выведет пример входного YAML, который можно использовать с --cli-input-yaml. Если предоставлено значение output, оно проверяет входные данные команды и возвращает пример выходного JSON для этой команды. Сгенерированный JSON-скелет не является стабильным между версиями AWS CLI, и нет гарантий обратной совместимости в сгенерированном JSON-скелете.

Глобальные параметры

--debug (логическое)

Включить отладочную запись журнала.

--endpoint-url (строка)

Переопределить значение по умолчанию URL команды заданным URL.

--no-verify-ssl (логическое)

По умолчанию AWS CLI использует SSL при общении с AWS-сервисами. Для каждого соединения SSL AWS CLI будет проверять сертификаты SSL. Этот параметр переопределяет поведение проверки сертификатов SSL по умолчанию.

--no-paginate (логическое)

Отключить автоматическую постраничную навигацию. Если автоматическая постраничная навигация отключена, AWS CLI сделает только один вызов для первой страницы результатов.

--output (строка)

Стиль форматирования вывода команды.

• json
• текст
• таблица
• yaml
• yaml-поток

--query (строка)

Запрос JMESPath для фильтрации данных ответа.

--profile (строка)

Использовать определённый профиль из файла ключей.

--region (строка)

Регион для использования. Переопределяет настройки конфигурации/среды.

--version (строка)

Отобразить версию этого инструмента.

--color (строка)

Включить/отключить цветной вывод.

• включить
• выключить
• автоматически

--no-sign-request (логическое)

Не подписывать запросы. Ключи не будут загружены, если этот аргумент предоставлен.

--ca-bundle (строка)

Набор сертификатов CA для использования при проверке SSL-сертификатов. Переопределяет настройки конфигурации/среды.

--cli-read-timeout (целое число)

Максимальное время чтения сокета в секундах. Если значение установлено в 0, чтение сокета будет блокирующим и не будет таймаута. Значение по умолчанию составляет 60 секунд.

--cli-connect-timeout (целое число)

Максимальное время подключения сокета в секундах. Если значение установлено в 0, подключение сокета будет блокирующим и не будет таймаута. Значение по умолчанию составляет 60 секунд.

--cli-binary-format (строка)

Стиль форматирования, который будет использоваться для двоичных блоков. Формат по умолчанию — base64. Формат base64 ожидает, что двоичные блоки будут предоставлены в виде строки, закодированной в base64. Формат raw-in-base64-out сохраняет совместимость с поведением AWS CLI V1, и двоичные значения должны передаваться буквально. При предоставлении содержимого из файла, которое отображается на двоичный блок fileb://, всегда будет рассматриваться как двоичный и будет использовать содержимое файла непосредственно независимо от настройки cli-binary-format. При использовании file:// содержимое файла должно быть должным образом отформатировано для настроенного cli-binary-format.

• base64
• raw-in-base64-out

--no-cli-pager (логическое)

Отключить пейджер cli для вывода.

--cli-auto-prompt (логическое)

Автоматически запросить параметры входных данных CLI.

--no-cli-auto-prompt (логическое)

Отключить автоматическое запрошенных параметров входных данных CLI.

Примеры

Для загрузки части набора чтений.

Следующий upload-read-set-part пример загружает указанную часть набора чтений.

aws omics upload-read-set-part \
    --sequence-store-id 0123456789 \
    --upload-id 1122334455 \
    --part-source SOURCE1 \
    --part-number 1 \
    --payload /path/to/file/read_1_part_1.fastq.gz

Вывод:

{
    "checksum": "984979b9928ae8d8622286c4a9cd8e99d964a22d59ed0f5722e1733eb280e635"
}

Дополнительную информацию см. в разделе Прямая загрузка в хранилище последовательностей в руководстве пользователя AWS HealthOmics.

Вывод

checksum -> (строка)