Windows: Хранилище представляет собой зашифрованный файл в каталоге MySQL Workbench data. Здесь находятся файлы connections.xml и связанные с ним файлы. Файл шифруется с помощью API Windows, который выполняет шифрование на основе текущего пользователя, поэтому только текущий пользователь может его расшифровать. В результате расшифровать файл на другом компьютере невозможно. Можно удалить файл, в этом случае все сохраненные пароли будут потеряны, но MySQL Workbench в остальном будет работать как ожидается. После этого необходимо повторно ввести пароли по мере необходимости.

macOS: Хранилище реализовано с использованием Secure Keychain. Содержимое хранилища также отображается в утилите Keychain Access.app.

Linux: Хранилище работает, сохраняя пароли с использованием библиотеки libsecret, которая взаимодействует с Secret Service. Для систем с настольной средой GNOME, например Ubuntu, Secret Service является gnome-keyring-daemon. Системы с настольной средой KDE, например Kubuntu, используют собственную реализацию ksecretservice.