Если вы настроили статистику оптимизатора без сохранения (настройка отличная от по умолчанию), InnoDB вычисляет значения индексов для таблицы в первый раз при обращении к ней после запуска, вместо сохранения этих значений в таблице. Этот шаг может занять значительное время на системах, которые разбивают данные на множество таблиц. Поскольку эта дополнительная нагрузка применяется только к первоначальному открытию таблицы, для того, чтобы “разогреть” таблицу для последующего использования, обратитесь к ней сразу после запуска, выполнив оператор, например, SELECT 1 FROM tbl_name LIMIT 1.

Статистика оптимизатора по умолчанию сохраняется на диск, что активируется параметром конфигурации innodb_stats_persistent. Подробнее о постоянной статистике оптимизатора см. Раздел 17.8.10.1, «Настройка параметров статистики оптимизатора, сохраняемой на диск».