Укажите первичный ключ для каждой таблицы, используя наиболее часто запрашиваемый столбец или столбцы, или значение автоинкремента, если нет очевидного первичного ключа.

Используйте соединения, когда данные извлекаются из нескольких таблиц на основе идентичных значений ID из этих таблиц. Для быстрой работы с соединениями определите внешние ключи в столбцах соединения и объявите эти столбцы с одинаковым типом данных в каждой таблице. Добавление внешних ключей гарантирует, что связанные столбцы будут индексированы, что может повысить производительность. Внешние ключи также распространяют удаления и обновления на все затронутые таблицы и предотвращают вставку данных в дочернюю таблицу, если соответствующие ID отсутствуют в родительской таблице.

Отключите автоматическое подтверждение. Подтверждение сотен раз в секунду ограничивает производительность (ограничено скоростью записи вашего хранилища).

Группируйте наборы связанных операций DML в транзакции, используя операторы START TRANSACTION и COMMIT. Хотя вы не хотите подтверждать слишком часто, вы также не хотите выдавать огромные партии операторов INSERT, UPDATE или DELETE, которые работают часами без подтверждения.

Не используйте операторы LOCK TABLES. InnoDB может обрабатывать несколько сессий, одновременно читающих и записывающих в одну и ту же таблицу, не жертвуя надёжностью или высокой производительностью. Чтобы получить эксклюзивный доступ для записи к набору строк, используйте синтаксис SELECT ... FOR UPDATE для блокировки только тех строк, которые вы намерены обновить.

Включите переменную innodb_file_per_table или используйте общие табличные пространства, чтобы поместить данные и индексы таблиц в отдельные файлы вместо системного табличного пространства. Переменная innodb_file_per_table включена по умолчанию.

Оцените, приносят ли ваши данные и шаблоны доступа пользу от функций сжатия таблиц и страниц InnoDB. Вы можете сжимать таблицы InnoDB без потери способности к чтению/записи.

Запустите сервер с опцией --sql_mode=NO_ENGINE_SUBSTITUTION, чтобы предотвратить создание таблиц с движками хранения, которые вы не хотите использовать.