Еще до начала проектирования NDBCLUSTER в 1996 году стало ясно, что одной из основных проблем при создании параллельных баз данных будет взаимодействие между узлами в сети. По этой причине NDBCLUSTER с самого начала был разработан для поддержки использования нескольких различных механизмов передачи данных или транспортёров.

NDB Cluster поддерживает три из них (см. Раздел 25.2.1, «Основные концепции NDB Cluster»). Четвертый транспортёр, Scalable Coherent Interface (SCI), также поддерживался в очень старых версиях NDB. Это требовало специализированного оборудования, программного обеспечения и библиотек MySQL, которые больше недоступны.