Spec-Zone.ru › scikit-learn

Примечание

Перейти к концу для скачивания полного кода примера. Или запустить этот пример в браузере через JupyterLite или Binder

Построение дендрограммы иерархической кластеризации

В этом примере строится дендрограмма иерархической кластеризации с использованием AgglomerativeClustering и метода дендрограммы из scipy.

Hierarchical Clustering Dendrogram
import numpy as np
from matplotlib import pyplot as plt
from scipy.cluster.hierarchy import dendrogram

from sklearn.cluster import AgglomerativeClustering
from sklearn.datasets import load_iris


def plot_dendrogram(model, **kwargs):
    # Create linkage matrix and then plot the dendrogram

    # create the counts of samples under each node
    counts = np.zeros(model.children_.shape[0])
    n_samples = len(model.labels_)
    for i, merge in enumerate(model.children_):
        current_count = 0
        for child_idx in merge:
            if child_idx < n_samples:
                current_count += 1  # leaf node
            else:
                current_count += counts[child_idx - n_samples]
        counts[i] = current_count

    linkage_matrix = np.column_stack(
        [model.children_, model.distances_, counts]
    ).astype(float)

    # Plot the corresponding dendrogram
    dendrogram(linkage_matrix, **kwargs)


iris = load_iris()
X = iris.data

# setting distance_threshold=0 ensures we compute the full tree.
model = AgglomerativeClustering(distance_threshold=0, n_clusters=None)

model = model.fit(X)
plt.title("Hierarchical Clustering Dendrogram")
# plot the top three levels of the dendrogram
plot_dendrogram(model, truncate_mode="level", p=3)
plt.xlabel("Number of points in node (or index of point if no parenthesis).")
plt.show()

Общее время выполнения скрипта: (0 минут 0,096 секунд)

Launch binder
Launch JupyterLite

Download Jupyter notebook: plot_agglomerative_dendrogram.ipynb

Download Python source code: plot_agglomerative_dendrogram.py

Download zipped: plot_agglomerative_dendrogram.zip

Связанные примеры

Понимание структуры дерева решений

Демонстрация структурированной иерархической кластеризации Уорда на изображении монет

Иерархическая кластеризация: структурированный против неструктурированного Уорда

Сравнение различных методов связывания иерархической кластеризации на наборах данных

© 2007–2025 The scikit-learn developers
Licensed under the 3-clause BSD License.
https://scikit-learn.org/1.6/auto_examples/cluster/plot_agglomerative_dendrogram.html

Spec-Zone.ru

Настройки Оффлайн Что нового Помощь О нас
Spec-Zone .ru
спецификации, руководства, описания, API