numpy.memmap

class numpy.memmap [source]

Создаёт сопоставление с памятью массива, хранящегося в бинарном файле на диске.

Файлы с сопоставлением с памятью используются для доступа к небольшим фрагментам больших файлов на диске без чтения всего файла в память. Объекты memmap NumPy — это объекты, похожие на массивы. Это отличается от модуля mmap Python, который использует объекты типа «поток данных».

Этот подкласс ndarray имеет некоторые неприятные взаимодействия с некоторыми операциями, потому что он не подходит как подкласс. Альтернативой использованию этого подкласса является создание объекта mmap самостоятельно, а затем создание ndarray с помощью ndarray.__new__ непосредственно, передав созданный объект в параметр ‘buffer=‘.

Этот класс может в какой-то момент быть преобразован в функцию-фабрику, возвращающую представление буфера mmap.

Удалите экземпляр memmap, чтобы закрыть файл memmap.

Параметры

filenamestr, file-like object, or pathlib.Path instance

Имя файла или объект файла, который используется в качестве буфера данных массива.

dtypedata-type, optional

Тип данных, используемый для интерпретации содержимого файла. По умолчанию это uint8.

mode{‘r+’, ‘r’, ‘w+’, ‘c’}, optional

Файл открывается в этом режиме:

‘r’	Открыть существующий файл только для чтения.
‘r+’	Открыть существующий файл для чтения и записи.
‘w+’	Создать или перезаписать существующий файл для чтения и записи.
‘c’	Копирование при записи: присваивания влияют на данные в памяти, но изменения не сохраняются на диск. Файл на диске доступен только для чтения.

По умолчанию это ‘r+’.

offsetint, optional

В файле данные массива начинаются с этого смещения. Так как offset измеряется в байтах, обычно это должно быть кратное размеру байта dtype. Когда mode != 'r', даже положительные смещения за пределами конца файла допустимы; Файл будет расширен для размещения дополнительных данных. По умолчанию memmap будет начинаться с начала файла, даже если filename является указателем на файл fp и fp.tell() != 0.

shapetuple, optional

Желаемая форма массива. Если mode == 'r' и число оставшихся байтов после offset не кратно размеру байта dtype, вы должны указать shape. По умолчанию возвращаемый массив будет одномерным с количеством элементов, определяемым размером файла и типом данных.

order{‘C’, ‘F’}, optional

Укажите порядок расположения памяти ndarray: строчный, стиль C или столбцовый, стиль Fortran. Это имеет значение только если форма больше, чем 1-мерная. По умолчанию порядок — ‘C’.

См. также

lib.format.open_memmap

Создайте или загрузите файл .npy с сопоставлением с памятью.

Примечания

Объект memmap может использоваться везде, где принимается ndarray. При заданном memmap fp, isinstance(fp, numpy.ndarray) возвращает True.

Файлы с сопоставлением с памятью не могут быть больше 2 ГБ на 32-битных системах.

Когда memmap приводит к созданию или расширению файла за пределы его текущего размера в файловой системе, содержимое новой части не определено. На системах с семантикой POSIX файловой системы расширенная часть будет заполнена нулевыми байтами.

Примеры

>>> data = np.arange(12, dtype='float32')
>>> data.resize((3,4))

В этом примере используется временный файл, чтобы doctest не записывал файлы в вашу директорию. Вы бы использовали «обычное» имя файла.

>>> from tempfile import mkdtemp
>>> import os.path as path
>>> filename = path.join(mkdtemp(), 'newfile.dat')

Создаём memmap с типом данных и формой, которые соответствуют нашим данным:

>>> fp = np.memmap(filename, dtype='float32', mode='w+', shape=(3,4))
>>> fp
memmap([[0., 0., 0., 0.],
        [0., 0., 0., 0.],
        [0., 0., 0., 0.]], dtype=float32)

Записываем данные в массив memmap:

>>> fp[:] = data[:]
>>> fp
memmap([[  0.,   1.,   2.,   3.],
        [  4.,   5.,   6.,   7.],
        [  8.,   9.,  10.,  11.]], dtype=float32)

>>> fp.filename == path.abspath(filename)
True

Удаление сбрасывает изменения в памяти на диск перед удалением объекта:

>>> del fp

Загружаем memmap и проверяем, что данные были сохранены:

>>> newfp = np.memmap(filename, dtype='float32', mode='r', shape=(3,4))
>>> newfp
memmap([[  0.,   1.,   2.,   3.],
        [  4.,   5.,   6.,   7.],
        [  8.,   9.,  10.,  11.]], dtype=float32)

Только чтение memmap:

>>> fpr = np.memmap(filename, dtype='float32', mode='r', shape=(3,4))
>>> fpr.flags.writeable
False

memmap только для копирования при записи:

>>> fpc = np.memmap(filename, dtype='float32', mode='c', shape=(3,4))
>>> fpc.flags.writeable
True

Возможно присвоить значения массиву только для копирования при записи, но значения записываются только в копию массива в памяти, а не на диск:

>>> fpc
memmap([[  0.,   1.,   2.,   3.],
        [  4.,   5.,   6.,   7.],
        [  8.,   9.,  10.,  11.]], dtype=float32)
>>> fpc[0,:] = 0
>>> fpc
memmap([[  0.,   0.,   0.,   0.],
        [  4.,   5.,   6.,   7.],
        [  8.,   9.,  10.,  11.]], dtype=float32)

Файл на диске не изменяется:

>>> fpr
memmap([[  0.,   1.,   2.,   3.],
        [  4.,   5.,   6.,   7.],
        [  8.,   9.,  10.,  11.]], dtype=float32)

Смещение в memmap:

>>> fpo = np.memmap(filename, dtype='float32', mode='r', offset=16)
>>> fpo
memmap([  4.,   5.,   6.,   7.,   8.,   9.,  10.,  11.], dtype=float32)

Атрибуты

filenamestr or pathlib.Path instance

Путь к сопоставленному файлу.

offsetint

Смещение в файле.

modestr

Режим файла.

Методы

flush(self)

Записать любые изменения в массиве в файл на диске.